제약회사 연구원의 블로그

1. 왜 지금 GDV인가: 작은 체적이 가져오는 큰 변화제약·바이오 분석 현장에서 몇 년째 가장 자주 듣는 고민은 “왜 같은 그라디언트 조건인데 RT가 0.2~0.5분씩 밀리지?”라는 질문이다.LC-MS/MS 분석이 안정적으로 돌아갈 때는 아무도 GDV를 언급하지 않는다. 그러나 작업량이 늘고, 분석 대상이 증가하고, 고처리량(HT) 분석이나 긴 Sequence를 돌릴 때 RT가 예측과 다르게 이동하면 문제는 갑자기 심각해진다.특히 최근 국내 제약사에서는 다음과 같은 상황이 더 자주 발생한다.같은 batch 내에서도 전반부·후반부 시료의 RT가 다르게 나타남해외 CRO에서 전달된 gradient 조건을 그대로 복제했는데 retention reproducibility가 맞지 않음column batch ch..

― LC-MS/MS 정량 분석에서 ‘한 개의 Q ion에 의존하는 방식’을 넘어서LC-MS/MS 기반 정량 분석에서 가장 오래된 관습 중 하나는 단일 quantifier ion(MRM transition)에만 의존해 약물 농도를 산출하는 방식이다. 이 방식은 단순하고 실무 적용이 쉽다는 장점이 있지만, 최근 몇 년 사이 제약사 분석팀에서는 다음과 같은 문제들을 반복적으로 경험하게 되면서 결국 단일 Q ion 의존 방식의 한계를 드러내기 시작했다.Matrix effect가 특정 fragment만 선택적으로 억제Low-level quantitation에서 간헐적 peak distortionLot-to-lot matrix 변화(혈장·전혈·소변·조직)에서 signal driftInterference 신호가 qu..

LC-MS/MS에서 가장 과소평가되지만 실제 분석 현장에서 결과 재현성을 결정짓는 절대 요소는 바로 spray stability이다. 특히 최근 국내 제약사 분석팀에서 HRMS 기반 대사체 분석, 약물 대사체 구조 동정, low-fg 수준 약물 모니터링 연구가 증가하면서, 기존 micrometer-sized ESI emitter 대신 nano-flow 기반 nano-ESI emitter 사용이 빠르게 늘고 있다. 하지만 nano-flow LC 시스템은 예민하고, emitter 팁 구조·전압·거리·용매 조성 변화에 따라 스프레이가 즉시 붕괴되거나 방울형 모드로 전환되기 때문에, 많은 연구자들이 “감도는 좋은데 재현성이 너무 떨어지는” 문제를 경험하게 된다.이 글에서는 nano-ESI emitter에서의 s..

— 혈장, 전혈, 소변, 조직에서의 LC-MS/MS ion suppression 실무 가이드LC-MS/MS 기반 바이오애널리틱스에서 ion suppression (또는 enhancement) 은 정량 정확도와 재현성을 해치는 가장 흔한 문제 중 하나다. 같은 분석법을 서로 다른 matrix(혈장, 전혈, 소변, 조직)에 적용하면, matrix에 포함된 성분(지질, 단백질, 염류, 담즙산류, 대사물 등)이 이온화 효율에 미치는 영향이 달라져 같은 화합물이라도 정량 결과가 달라진다. 따라서 matrix별 ion suppression 특성을 체계적으로 비교하고, 그 결과를 바탕으로 분석법(전처리, internal standard 전략, chromatography, MS 설정 등)을 최적화하는 것은 제약사·CR..

― 국내 제약사 분석팀을 위한 현실적 활용 전략과 workflow 비교1. 서론: 두 기기의 목적은 “서로 다르고”, 그래서 “서로 필요하다”신약 개발 과정에서 약물 분석팀은 항상 두 가지 요구 사이를 오가게 된다.하나는 정확한 농도 측정, 다른 하나는 약물이 어떤 형태로 변하는지 구조적으로 파악하는 것이다.그래서 대부분의 제약사 분석실에는 두 종류의 장비가 공존한다.HRMS(High Resolution Mass Spectrometry)→ Q-TOF, Orbitrap 등→ 정체를 알 수 없는 unknowns를 밝히는 장비Triple Quadrupole (Triple Quad, QqQ)→ TSQ, 6500+, 8060 등→ 정량을 위해 존재하는 장비이 둘은 가격도 다르고, 분석 속도도 다르고, 분석에서 수..

1. 들어가며: 왜 지금 High-throughput LC-MS/MS인가?제약사 분석팀에서 하루에도 수백~수천 개의 시료를 분석해야 하는 상황은 더 이상 이례적인 일이 아니다. 장기 안전성 시험, 비임상 독성시험, FIH 초기 임상에서 수집되는 PK 시료, formulation별 비교 연구까지 겹치면, 어느 순간부터 분석팀의 일상은 “샘플이 쌓여가는 속도를 장비가 따라가지 못하는” 상태에 빠지게 된다.최근 몇 년 동안 국내 제약사, 특히 한미약품처럼 파이프라인이 넓고 임상 단계가 다양하게 병행되는 기업의 경우, 분석팀은 단순히 정확한 LC-MS/MS 분석뿐 아니라 분석 속도(time-to-result)를 경쟁력으로 삼아야 하는 상황에 들어섰다. 신약 개발 속도가 곧 회사의 생존과 직결되는 시대이기 때문이..

― 국내 제약사 분석팀의 생산성·정확도·데이터 품질을 혁신하는 자동화 전략바이오의약품과 정밀의학 시대가 본격화되면서 제약사 분석팀의 업무 강도는 점점 높아지고 있다. 특히 LC-MS/MS 기반 정량 분석은 고감도 분석 장비를 다루는 데서 오는 높은 난이도, 복잡한 시료 처리 과정, 기준에 맞춘 엄격한 method validation 요구사항 등으로 인해 “사람 손”이 매우 많이 필요하다. 그런데 최근 3~4년 사이, 글로벌 제약사와 선진 CRO를 중심으로 sample preparation 자동화, 즉 lab automation과 LC-MS/MS 워크플로우의 연동이 빠르게 확산되고 있다.국내 분석팀에서도 로봇 자동화에 대한 관심은 꾸준히 높아졌지만, 실제 도입 단계까지 이어지는 경우는 많지 않다. 가장 큰..

― LC-MS/MS 분석 품질을 개선하는 차세대 통합 접근법LC-MS/MS 분석의 성패를 가르는 요소 중 하나는 바로 peak integration이다.피크의 시작점과 끝점을 어디에 두느냐, baseline을 어떻게 설정하느냐, shoulder peak 또는 co-eluting peak을 어떻게 처리하느냐는 정량 결과에 직접적인 영향을 끼친다.놀랍게도 오늘날 많은 제약사와 CRO에서도 peak integration은 여전히 분석자(analyst)의 경험과 판단에 의존하는 영역이다.분석자가 다르면 피크가 다르게 integration되고, 같은 분석자라도 날짜·피로도·업무량에 따라 결과가 달라지기도 한다. 이러한 human bias는 bioanalysis의 최대 변동 원인이 되며, method validat..