제약회사 연구원의 블로그

― 조직 전체 평균을 넘어, ‘어디에서 무엇이 변했는가’를 보는 분석 패러다임비임상 독성이나 약효 평가에서 우리는 오랫동안 하나의 전제를 받아들여 왔다.“조직을 균질화하면 그 안의 정보를 대표할 수 있다”는 가정이다.하지만 실제로는 간, 신장, 뇌 같은 조직은 매우 이질적이다. 간만 해도 periportal과 pericentral 영역은 대사 효소 발현부터 독성 민감도까지 전혀 다르다. 그럼에도 불구하고 기존 metabolomics 분석은 조직 전체를 갈아서 평균값으로 보고, 그 결과를 독성 기전이나 약효 설명에 사용해 왔다.이 한계를 정면으로 파고드는 기술이 바로 spatial metabolomics다.조직을 갈지 않고, 조직 내 위치 정보(spatial information)를 유지한 채 대사체 분포..

― 장내 미생물과 대사체 데이터를 연결해 약물 반응과 독성까지 해석하는 실전 전략최근 제약·바이오 연구에서 “마이크로바이옴(microbiome)”은 더 이상 유행어가 아니다. 실제로 임상 시험에서 동일한 약물을 투여했음에도 환자 간 반응 차이가 발생하는 이유 중 상당 부분이 장내 미생물과 대사체(metabolite)의 상호작용으로 설명되고 있다.Microbiome 자체만 분석해서는 충분하지 않고, metabolomics만으로도 기전을 설명하기 어렵다. 그래서 최근 주목받는 접근이 바로 Microbiome–metabolite interaction 분석, 즉 미생물 구성 변화 → 대사체 변화 → 약물 효능·독성·PK 변화를 하나의 workflow로 해석하는 전략이다.이 글에서는 분석팀 실무자가 실제로 적용할..

1. 서론 – Digital Twin과 약물 개발의 새로운 패러다임신약 개발에서 가장 큰 난관 중 하나는 약물 대사와 반응성을 개인별로 예측하는 문제입니다. 전임상 동물실험과 초기 임상 데이터는 일정 수준의 안전성과 효능을 보장하지만, 실제 환자 집단에서는 유전적 변이, 대사체 프로파일, 환경적 요인, 동반 질환, 병용 약물 등 수많은 변수가 복합적으로 작용합니다. 그 결과, 일부 환자에서는 예상치 못한 약물 독성(adverse drug reactions, ADRs)이 발생하거나, 반대로 충분한 치료 효과를 얻지 못하는 경우가 발생합니다.이러한 불확실성을 줄이기 위해 최근 제약·바이오 업계에서 주목하는 개념이 바로 Digital Twin입니다.Digital Twin은 환자의 유전체, 단백체, 대사체, 임..

장내 대사체가 약물 독성에 미치는 영향1. 서론 – 왜 “마이크로바이옴–대사체”가 약물 독성과 연결되는가신약 개발과 임상 적용 과정에서 가장 큰 과제 중 하나는 예상치 못한 독성(adverse drug reactions, ADRs)입니다. 특히, 전임상에서 안전성이 확인된 약물이 임상 단계에서 독성을 나타내는 경우는 제약 산업 전체에 막대한 손실을 초래합니다. 최근 연구들은 이러한 불확실성의 중요한 원인으로 장내 마이크로바이옴(microbiome)을 주목하고 있습니다.장내 미생물은 단순한 공생체가 아니라, 숙주의 약물 대사와 면역 반응을 적극적으로 조절하는 메타볼릭 엔진입니다. 즉, 약물이 체내에 들어온 뒤 간이나 신장에서 대사되기 전, 장내 세균이 먼저 해당 약물을 변형하거나, 대사체와 상호작용하여 독..