제약회사 연구원의 블로그

― “독성이 있다”가 아니라 “어디서, 왜 독성이 시작됐는가”를 설명하는 분석 프레임비임상 독성 평가에서 metabolomics는 이미 낯선 기술이 아니다.혈장, 소변, 조직 homogenate를 기반으로 한 toxicometabolomics는독성 조기 예측, 기전 가설 수립, 후보물질 탈락 판단에 실질적인 도움을 주고 있다.하지만 분석팀 실무자라면 한 번쯤 이런 한계를 느껴봤을 것이다.“독성 관련 대사체가 변한 건 알겠는데,이 변화가 조직의 어느 위치에서 시작된 건지는 알 수 없다.”바로 이 지점에서 spatial metabolomics가 toxicometabolomics와 만나야 한다.두 기술의 통합은 단순한 기술 결합이 아니라,비임상 독성 해석의 차원을 한 단계 끌어올리는 전략적 전환이다.이 글에서..

― 조직 전체 평균을 넘어, ‘어디에서 무엇이 변했는가’를 보는 분석 패러다임비임상 독성이나 약효 평가에서 우리는 오랫동안 하나의 전제를 받아들여 왔다.“조직을 균질화하면 그 안의 정보를 대표할 수 있다”는 가정이다.하지만 실제로는 간, 신장, 뇌 같은 조직은 매우 이질적이다. 간만 해도 periportal과 pericentral 영역은 대사 효소 발현부터 독성 민감도까지 전혀 다르다. 그럼에도 불구하고 기존 metabolomics 분석은 조직 전체를 갈아서 평균값으로 보고, 그 결과를 독성 기전이나 약효 설명에 사용해 왔다.이 한계를 정면으로 파고드는 기술이 바로 spatial metabolomics다.조직을 갈지 않고, 조직 내 위치 정보(spatial information)를 유지한 채 대사체 분포..

항암제 침투력 평가를 위한 대사 공간 분석 전략1. 서론 – 항암제가 “도달하지 못하는 영역”항암제가 아무리 강력한 기전을 가지고 있더라도, 실제 종양 내부에 충분히 침투하지 못한다면 효과는 제한적이다.이 현상은 특히 고형암(solid tumor)에서 두드러지는데, 표면부의 암세포는 약물에 노출되지만 중심부(necrotic core)는 저산소·영양 결핍 환경(hypoxia & nutrient deprivation) 속에 고립되어 약물 접근이 어렵다.그 결과,일부 세포만 사멸하고중심부의 저활성 암세포는 살아남아재발 혹은 내성 클론을 형성하는 악순환이 반복된다.이러한 “약물 침투력(drug penetration)” 문제는 오랫동안 항암제 개발의 병목이었다.최근 들어, 단순히 약물 농도를 정량하는 수준을 넘어..

MALDI-MSI 기반 조직 내 국소적 대사체 분포 분석과 항암제 침투(local penetration) 평가1. 서론: 종양 미세환경과 공간적 대사체 분석의 필요성종양(tumor)은 단순히 암세포 덩어리가 아니라, 혈관, 면역세포, 섬유모세포, 세포외기질(ECM) 등이 얽혀 있는 복잡한 미세환경(tumor microenvironment, TME) 속에서 성장한다. 최근 항암제 개발 및 반응성 평가에서 "평균적인 세포 대사 패턴"만을 보는 기존 접근법의 한계가 지적되고 있으며, 세포군 또는 조직 내 공간적 이질성(spatial heterogeneity) 을 이해하는 것이 치료 전략 최적화에 필수적임이 강조되고 있다.이러한 배경에서 Spatial Metabolomics 는 LC-MS/MS 및 mass sp..