제약회사 연구원의 블로그

– “단일 오믹스로는 절대 보이지 않는 신호들”1. 서론 – “독성은 한 지점에서 발현되지만, 원인은 네트워크 전체에서 시작된다”신약 개발 과정에서 가장 치명적인 리스크는 결국 “독성”이다.in vitro에서는 아무 문제 없던 화합물이 in vivo에서 갑자기 간독성을 보이고,임상에서는 환자 일부에서 예측 불가능한 부작용이 터진다.전통적인 방식은 특정 biomarker를 모니터링하거나PK profile에서 노출도(exposure)를 확인하는 수준이었다.하지만 독성이란 게 그렇게 단순하지 않다.독성은 대개 대사 경로의 무너짐(metabolic collapse)과단백체 수준에서의 기능적 붕괴(proteome disruption)가 복합적으로 일어나면서 나타난다.그래서 등장하는 접근이 바로 Proteomics..

LC-MS/MS 기반 kinetic profiling 전략1. 서론 – “Metabolite는 순간의 흔적이 아니라, 반응의 방향이다”신약 후보 물질이 체내에서 어떻게 대사되는지를 이해하는 건 단순한 독성 예측의 문제가 아니다.대사체는 단순히 ‘분해 산물’이 아니라, 시간과 효소의 상호작용이 남긴 흔적이다.즉, metabolite profiling은 정적인 스냅샷이 아니라 동적인 경로 해석 도구다.그래서 최근 약물 분석 분야에서는 untargeted metabolomics보다targeted LC-MS/MS 기반 kinetic profiling이 주목받고 있다.Targeted metabolomics는 미리 정의된 대사체(예: parent drug, Phase I/II metabolite)를정량적 preci..

– LC-MS/MS 기반 대사체 데이터에서 precision dosing으로1. 서론 – “모든 환자에게 같은 용량은, 더 이상 과학이 아니다”임상시험에서 같은 용량의 약물을 투여해도,누군가는 극적인 치료 효과를 보이고 누군가는 부작용으로 고생한다.이건 단순한 PK variability(약물 농도의 차이)가 아니다.환자 개개인의 대사체 프로파일(metabolic phenotype)이 다르기 때문이다.그래서 등장한 개념이 바로 Pharmacometabolomics —약물 반응을 ‘유전자(genotype)’가 아닌 ‘대사체(metabolome)’ 수준에서 해석하려는 접근이다.즉, 약물이 체내에 들어가 ‘어떻게 작용했는가’가 아니라,‘그 약물을 맞이한 신체의 대사 환경이 어떤 상태였는가’를 기반으로반응성(re..

1. 서론 – “stability는 검증의 마지막 단계가 아니라, method의 일상 테스트다”Bioanalytical validation에서 stability 항목은 흔히 ‘마지막 단계’로 다뤄진다.정확도, 정밀도, 회수율, selectivity, carry-over 등 주요 항목이 끝나면마지막으로 bench-top, autosampler, extract, freeze-thaw stability를 수행하는 식이다.하지만 실제 분석팀 관점에서 보면 stability는“마지막에 검증하는 항목”이 아니라,“매일 반복되는 분석의 신뢰도를 증명하는 테스트”다.특히 extract stability와 bench-top stability는시료 전처리 및 보관 환경의 미세한 차이가 결과를 완전히 바꿔버릴 수 있다.즉,..

1. 서론 – “Validation은 규제 대응이 아니라, 데이터의 품질 선언이다”바이오분석(bioanalysis) 업계에 오래 있다 보면 공통된 진실 하나를 마주한다.정량분석에서 가장 무서운 건 장비가 아니다. 불완전한 validation이다.심지어 분석 자체보다 validation 문서를 준비하는 시간이 길다.이유는 명확하다. LC-MS/MS 데이터는 곧 임상 개발의 생명줄이기 때문이다.특히 ICH M10 가이드라인이 본격 적용되면서전 세계적으로 bioanal validation 기준이 정돈되고 강화됐다.미국 FDA, EMA, PMDA, MFDS까지 모두 이 틀을 공유한다.말 그대로, 이제는 “대충 검증해서 넘어가는 시대”가 끝났다.국내 분석팀도 이 흐름 위에 서 있다.실험실 한쪽에서는 plasma ..

1. 서론 – “칼럼은 소모품이 아니라, 데이터의 신뢰성을 좌우하는 생체 기관이다”LC-MS/MS 분석을 하다 보면 누구나 한 번쯤 이런 경험을 한다.“어제까지 retention time(RT)이 3.2분이었는데, 오늘은 3.5분으로 밀렸다.”칼럼이 깨진 것도 아니고, mobile phase도 그대로인데 왜 이런 일이 벌어질까?그 이유는 단순하다.Column은 시간이 지남에 따라 노화(aging)한다.즉, stationary phase의 화학적 특성과 표면 활성도가 변하면서분리(selectivity)와 보유(retention)가 서서히 달라지는 것이다.이 현상은 단순히 RT shift에 그치지 않는다.정량 분석에서는 calibration curve의 slope가 미묘하게 변하고,MRM transition..

― LC-MS/MS 정량 분석에서 “보이지 않는 손실”을 과학적으로 제어하기1. 서론 – 높은 매트릭스 복잡도 속 감도 저하의 딜레마LC-MS/MS 분석에서 가장 자주 듣는 말 중 하나는 “signal이 안 올라간다”일 것이다.특히 혈장, 소변, 조직 균질물(tissue homogenate)과 같은 high matrix biological sample에서는동일한 농도의 분석물질(analyte)을 주입해도 signal intensity가 절반 이하로 감소하는 경우가 흔하다.이 현상의 주된 원인이 바로 ion suppression이다.Ion suppression은 LC로 분리된 시료가 ESI (Electrospray Ionization) 또는 APCI 소스를 거칠 때,시료 내 공존물질(matrix compo..

– LC-MS/MS 정량 분석에서 “보이지 않는 신호”를 끌어올리는 과학1. 서론 – 감도(sensitivity)는 운이 아니라 설계의 결과다LC-MS/MS 분석에서 감도는 단순히 장비의 스펙으로만 결정되지 않는다.같은 기기, 같은 컬럼, 같은 mobile phase를 사용해도 연구자에 따라 감도가 2배 이상 차이나는 경우가 있다.그 이유는 mass spectrometer tuning과 ion source parameter 세팅의 차이 때문이다.이 두 영역은 “MS가 신호를 보는 눈의 해상도”를 조정하는 과정이다.조금만 조정이 어긋나도 peak intensity는 떨어지고, noise는 증가한다.🎯 결국 고감도 분석은 장비가 아니라, “튜닝 능력”이 만든다.2. Mass spectrometer tuni..