제약회사 연구원의 블로그

1. 왜 cytokine–metabolite 상관분석인가?사이토카인은 면역계의 ‘메시지’이고, 대사체는 세포의 ‘상태·연료·스트레스’입니다. 둘을 결합하면 “면역 신호가 어떤 대사 경로를 유도하는지(또는 반대인지)”에 대한 생물학적 인과가설을 만들 수 있습니다.예: 감염·염증 상황에서 IDO1 활성→tryptophan→kynurenine 증가가 IFN-γ와 연동되는지 확인하면 면역억제 메커니즘을 제시할 수 있습니다. 2. 연구 설계 — 시작 전에 반드시 결정할 것들질문(가설)을 명확히: 탐색적 네트워크 발굴인지, 특정 경로(예: kynurenine–IL-6) 검증인지.매트릭스 선택: 혈장(plasma) vs 혈청(serum) vs 조직 vs 세포 배양액. (혈장과 혈청은 cytokine 수준·대사체에 차..

— LC-MS/MS와 Systems Toxicology 융합 전략 1. 서론: 비임상 독성 평가의 한계와 Metabolomics의 필요성신약 개발 과정에서 독성 평가(toxicology study)는 필수적 단계이며, 전임상 동물 모델을 통해 안전성을 확보한 후에야 임상으로 진입할 수 있다. 하지만 기존의 독성 시험은 병리학적 변화(histopathology), 혈액생화학(biochemistry), 조직학적 검사에 크게 의존하고 있어, 독성 발현이 상당히 진행된 이후에야 확인 가능한 경우가 많다.따라서 독성이 발현되기 전, 즉 early toxicity signal을 포착할 수 있는 분석 플랫폼이 필요하며, 최근 LC-MS/MS 기반 metabolomics가 주목받고 있다. 대사체는 세포 수준에서 빠르게..

1. 서론: 약물 반응성 예측의 새로운 패러다임신약 개발과 임상 치료에서 가장 큰 난제 중 하나는 환자마다 다른 약물 반응성이다. 동일한 항암제를 투여했을 때 일부 환자는 완전 관해(complete remission)를 경험하는 반면, 다른 환자는 거의 효과를 보지 못하거나 심각한 부작용을 겪는다. 이러한 개인 간 반응 차이를 설명하기 위해 유전체(pharmacogenomics) 연구가 오랫동안 주류를 이루었지만, 실제 임상에서는 단일 유전자 변이가 약물 반응성을 온전히 설명하지 못하는 경우가 많았다.이에 따라 연구자들은 다층적(omics) 접근법을 도입하게 되었고, 최근 주목받는 전략이 바로 대사체(metabolome)와 단백체(proteome)의 통합 분석이다.대사체 분석은 세포 내 대사 흐름과 최종..

1. 서론: 암 대사 연구와 Oncometabolite의 부상암 연구의 패러다임은 지난 수십 년간 유전자 돌연변이와 신호전달 네트워크에 초점을 맞추어 발전해 왔다. 그러나 최근 들어 암의 본질적 특성을 이해하는 데 있어 세포 대사(metabolism)의 변화가 핵심적 역할을 차지한다는 사실이 명확히 드러나고 있다. 암세포는 빠른 성장과 증식을 위해 정상 세포와는 다른 대사 경로를 활용하며, 이러한 비정상적 대사 산물을 온코메타볼라이트(oncometabolite)라 부른다.대표적인 온코메타볼라이트로는 succinate, fumarate, 2-hydroxyglutarate (2-HG)가 있으며, 이들은 단순한 부산물이 아니라 에피제네틱(epigenetic) 조절 및 세포 운명 결정에 직접적으로 관여한다. 특..

1. 서론: 의약품 안정성 평가와 분석법 개발의 중요성의약품 개발 과정에서 안정성(stability) 은 품질 보증과 환자 안전을 결정짓는 핵심 요소이다. 안정성이란 단순히 약물이 “효능을 유지하는가”를 넘어, 저장 중 또는 투여 과정에서 분해산물(degradation products) 이 생성되는지를 평가하고, 그 생성물이 환자에게 독성 또는 예기치 못한 약리 효과를 유발하지 않는지 확인하는 과정까지 포함한다.국제적으로는 ICH Q1A(R2): Stability Testing of New Drug Substances and Products 가 표준 가이드라인으로 자리 잡고 있으며, 제약사는 이를 근거로 Stability-indicating method(SIM) 를 개발하고 검증해야 한다. SIM은 단순..

1. 서론 – TDM의 필요성과 임상적 의의약물 치료에서 환자의 반응은 개인마다 크게 달라질 수 있다. 동일한 약물을 같은 용량으로 투여해도 어떤 환자는 충분한 치료 효과를 얻는 반면, 다른 환자는 부작용을 경험하거나 기대보다 낮은 효과를 보이는 경우가 흔하다. 이러한 변이는 약물의 약동학적(PK) 차이와 약력학적(PD) 반응성 차이에서 비롯되며, 특히 **혈중 약물 농도의 모니터링(TDM, Therapeutic Drug Monitoring)**은 임상 현장에서 맞춤형 약물 투여 전략을 수립하는 데 핵심적인 도구로 활용된다.TDM은 혈액, 혈장, 소변 등 체액에서 실제 약물 농도를 측정하여 환자의 투여 용량을 조정하는 임상적 접근이다. 항암제, 항경련제, 면역억제제, 항생제 등 좁은 치료창을 가진 약물에..

1. 서론: Combination Therapy와 정량 분석의 필요성항암제 개발에서 단일 기전 약물(monotherapy)의 한계를 극복하기 위한 전략으로 병용요법(combination therapy)이 빠르게 확산되고 있다. 암세포는 단일 신호전달 경로를 차단하는 치료에 대해 빠르게 적응하거나 내성을 획득하기 때문에, 여러 기전을 동시에 표적화하는 병용 접근법이 더 효과적이라는 것이 다양한 임상 데이터를 통해 입증되고 있다. 실제로 면역관문억제제(Immune checkpoint inhibitors, ICIs)와 타깃항암제(TKIs, PARP inhibitors 등), 혹은 항암제와 화학요법 병용은 다수의 암종에서 표준 치료 프로토콜로 자리잡고 있다.그러나 병용요법의 확산은 분석학적 측면에서 새로운 도전..

– Nano-flow LC와 Ion Funnel 기술의 융합적 접근1. 서론: 왜 초저농도 생체시료 분석이 중요한가현대 약물 분석에서 가장 도전적인 과제 중 하나는 초저농도(low-abundance) 생체시료에 포함된 물질을 정확하게 검출하고 정량하는 일입니다. 특히 항암제, 희귀질환 치료제, 혹은 신경전달물질과 같은 내인성 대사체(endogenous metabolites) 연구에서는 피코몰(pmol)~펨토몰(fmol) 단위의 극미량을 다루어야 합니다. 이 수준의 분석은 전통적인 LC-MS/MS 시스템으로는 잡음(noise)과 매트릭스 효과(matrix effect)에 묻히기 쉽습니다.예를 들어, 혈액이나 뇌척수액(CSF)에서 특정 대사체를 정량해야 하는 경우, 환자로부터 얻을 수 있는 샘플량은 극히 제..