제약회사 연구원의 블로그

이질적 암세포 집단에서 항암제 반응 규명 전략1. 서론 – 암 연구의 패러다임 전환암은 더 이상 단일 질환으로 규정되지 않습니다. 동일한 종양이라 하더라도, 그 내부에는 유전적·전사체적·대사체적 다양성을 지닌 세포 아형(subclone)들이 공존하고 있습니다. 이 세포들은 서로 다른 생리적 특성을 갖고 있으며, 항암제에 대한 민감성 또한 극명하게 갈립니다. 결국 암 치료 실패의 주요 원인 중 하나는 바로 이러한 세포 이질성(intra-tumoral heterogeneity)입니다.기존의 bulk RNA-seq이나 bulk metabolomics는 종양 내 모든 세포의 평균값을 제공하는 방식이었습니다. 그러나 평균값은 소수의 내성 클론이 암 재발을 일으키는 과정을 설명하지 못합니다. 따라서 최근 암 연구에..

1. 왜 ‘유전자+대사체’인가: 단독 오믹스의 한계를 넘는 조합유전자(원인): 대사효소/수송체/면역유전자 변이가 ADR 민감성을 선천적으로 규정(HLA-B*57:01—과민반응, CYP2C9·CYP2C19—대사저하 등). 단, 표현형 발현은 환경/병용약에 의해 좌우.대사체(현재 상태): 실제 노출(Exposure), 기관 스트레스(간담즙/신장/심근 대사 불균형), 염증 반응을 빠르게 반영(분~시간 단위).통합의 이점: “가능성(Genomics)×현재진행형(Metabolomics)”을 곱해 위험 ‘발화 전’ 조기 감지 및 개입 타이밍 최적화가 가능.실무 팁초기 파일럿에선 유전자 1·2개 + 5~20개 핵심 대사체로 시작해 신호를 확인하고, 이후 패널을 확장하는 Stage-up 전략이 비용·속도·규제 대응 모..

1. 서론: Drug Repositioning의 부상신약 개발은 평균 10~15년, 20억 달러 이상이 소요되는 고위험·고비용 과정이다. 하지만 기존에 승인된 약물을 새로운 적응증에 활용하는 Drug Repositioning (약물 재창출) 전략은 안전성 데이터가 이미 확보되어 있다는 점에서 개발 속도를 획기적으로 단축할 수 있다. 실제로 Sildenafil(비아그라, 원래는 협심증 → 발기부전), Thalidomide(기형아 유발 → 다발골수종 치료제) 사례처럼 repositioning은 신약 개발의 효율성을 높이는 핵심 전략으로 자리잡았다.최근에는 단순한 임상 관찰 기반 repositioning을 넘어, Multi-omics 데이터 통합 분석을 통해 새로운 기전을 발굴하고 적응증 확장을 시도하는 접근..

— LC-MS/MS와 Systems Toxicology 융합 전략 1. 서론: 비임상 독성 평가의 한계와 Metabolomics의 필요성신약 개발 과정에서 독성 평가(toxicology study)는 필수적 단계이며, 전임상 동물 모델을 통해 안전성을 확보한 후에야 임상으로 진입할 수 있다. 하지만 기존의 독성 시험은 병리학적 변화(histopathology), 혈액생화학(biochemistry), 조직학적 검사에 크게 의존하고 있어, 독성 발현이 상당히 진행된 이후에야 확인 가능한 경우가 많다.따라서 독성이 발현되기 전, 즉 early toxicity signal을 포착할 수 있는 분석 플랫폼이 필요하며, 최근 LC-MS/MS 기반 metabolomics가 주목받고 있다. 대사체는 세포 수준에서 빠르게..

1. 서론: 약물 반응성 예측의 새로운 패러다임신약 개발과 임상 치료에서 가장 큰 난제 중 하나는 환자마다 다른 약물 반응성이다. 동일한 항암제를 투여했을 때 일부 환자는 완전 관해(complete remission)를 경험하는 반면, 다른 환자는 거의 효과를 보지 못하거나 심각한 부작용을 겪는다. 이러한 개인 간 반응 차이를 설명하기 위해 유전체(pharmacogenomics) 연구가 오랫동안 주류를 이루었지만, 실제 임상에서는 단일 유전자 변이가 약물 반응성을 온전히 설명하지 못하는 경우가 많았다.이에 따라 연구자들은 다층적(omics) 접근법을 도입하게 되었고, 최근 주목받는 전략이 바로 대사체(metabolome)와 단백체(proteome)의 통합 분석이다.대사체 분석은 세포 내 대사 흐름과 최종..

1. 서론: 암 대사 연구와 Oncometabolite의 부상암 연구의 패러다임은 지난 수십 년간 유전자 돌연변이와 신호전달 네트워크에 초점을 맞추어 발전해 왔다. 그러나 최근 들어 암의 본질적 특성을 이해하는 데 있어 세포 대사(metabolism)의 변화가 핵심적 역할을 차지한다는 사실이 명확히 드러나고 있다. 암세포는 빠른 성장과 증식을 위해 정상 세포와는 다른 대사 경로를 활용하며, 이러한 비정상적 대사 산물을 온코메타볼라이트(oncometabolite)라 부른다.대표적인 온코메타볼라이트로는 succinate, fumarate, 2-hydroxyglutarate (2-HG)가 있으며, 이들은 단순한 부산물이 아니라 에피제네틱(epigenetic) 조절 및 세포 운명 결정에 직접적으로 관여한다. 특..

(Neuro-metabolomics Approaches for Early Detection Biomarkers in Parkinson’s and Alzheimer’s Disease)1. 서론: 신경질환 조기 진단의 필요성파킨슨병(Parkinson’s disease, PD)과 알츠하이머병(Alzheimer’s disease, AD)은 대표적인 퇴행성 신경질환으로, 전 세계적으로 노인 인구 증가와 함께 환자 수가 급격히 늘어나고 있다. 그러나 현재 임상에서 사용되는 진단 도구는 주로 인지기능 저하, 운동장애, 영상학적 변화 등 이미 진행된 단계에서 나타나는 지표에 의존한다. 이러한 한계로 인해 환자가 실제로 치료介入을 받는 시점은 병리학적 손상이 상당히 진행된 이후이며, 이는 치료 효과를 크게 제한한다.따라..

암 연구는 지난 수십 년간 분자생물학, 유전체학, 단백체학 등 다양한 오믹스(omics) 접근법을 통해 빠르게 발전해 왔습니다. 특히 최근에는 대사체학(metabolomics)이 주목받고 있는데, 이는 세포 내외에서 실제로 일어나는 화학적 변화와 에너지 흐름을 직접적으로 반영하기 때문입니다. 유전자나 단백질 수준의 변화가 잠재적 가능성을 보여주는 ‘설계도’라면, 대사체는 실제 ‘현장 상황’을 보여주는 지표라 할 수 있습니다.암 환자의 예후 예측(prognosis prediction) 은 임상에서 가장 중요한 과제 중 하나입니다. 어떤 환자가 치료에 잘 반응할지, 누가 재발 가능성이 높은지, 또는 특정 치료 전략에서 독성이 심할지를 미리 예측할 수 있다면, 불필요한 치료를 줄이고 개인 맞춤형 전략을 제시할..