Dynamic exclusion 설정이 결과를 왜곡하는 방식
— 더 많이 보기 위한 장치가, 오히려 덜 보게 만드는 순간처음 DDA method를 세팅할 때dynamic exclusion은 거의 당연한 옵션처럼 들어간다.설명도 단순하다.“이미 선택된 precursor를 일정 시간 동안 제외해서더 다양한 peptide를 보게 해준다”이론적으로는 완벽해 보인다.같은 것만 반복해서 분석하는 비효율을 줄이고,coverage를 넓혀준다.그래서 대부분의 경우별 고민 없이 기본값을 사용하거나조금 늘리거나 줄이는 정도로 끝난다.그런데 데이터를 몇 번 반복해서 보다 보면이 설정이 단순한 효율 문제가 아니라결과 자체를 바꾸고 있다는 느낌이 들기 시작한다.어떤 peptide는 항상 보이는데어떤 peptide는 run마다 사라지고특정 단백질은 예상보다 과소평가된다이쯤 되면 질문이 생긴..
제약산업
2026. 5. 9. 20:24
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