Ratio compression이 발생하는 구조
TMT/iTRAQ에서 실제 biological difference가 점점 작아져 보이는 이유처음 TMT나 iTRAQ 데이터를 접하면 대부분 비슷한 인상을 받는다. 데이터가 굉장히 깔끔해 보인다는 점이다. Missing value도 적고, replicate consistency도 높으며, reporter ion 기반 quantification 결과가 정돈된 숫자로 떨어진다. Heatmap은 선명하고 PCA clustering도 안정적으로 나타난다.그리고 어느 순간부터 연구자는 이런 생각을 하게 된다.“이 정도면 실제 biology를 꽤 정확하게 반영하는 것 아닐까?”실제로 isobaric labeling 기반 proteomics는 label-free quantification보다 훨씬 정교한 것처럼 보인다..
제약산업
2026. 5. 25. 20:20
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