제약회사 연구원의 블로그

— 바이오애널리시스 품질의 진짜 핵심을 드러내는 “ISR 실패”의 본질임상시험 시료 분석에서 ISR(Incurred Sample Reanalysis) 는 단순한 품질 지표가 아니다.많은 분석자들이 말하듯 “ISR은 바이오애널리시스의 민낯을 드러내는 항목”이며, method validation 때는 몰랐던 숨겨진 문제들이 실제 임상 시료에서 폭발적으로 드러나기도 한다.애초에 ISR이 필요한 이유도 여기에 있다.검증된 분석법이 임상시험이라는 “현실적인 조건”에서 여전히 재현성이 있는지를 확인하는 절차이기 때문이다.그러나 ISR 실패는 생각보다 흔하다. 국내 제약사 분석팀에서도 ISR 실패 때문에 다시 시료를 회수하고, 분석법을 재평가하거나, sponsor와 수차례 회의를 반복하는 일이 드물지 않다.이 글에서..

– amine, carbonyl, steroid 계 분석 감도·선택성 향상을 위한 실무형 접근LC-MS/MS 기반 분석에서 감도는 언제나 가장 현실적인 고민이다. 특히 신약 후보 물질처럼 낮은 농도로 존재하는 분석 대상이나, 내인성 대사체처럼 background 간섭이 많은 타깃을 분석할 때는 “현 시스템에서 감도를 얼마나 더 끌어올릴 수 있는가?”가 가장 중요한 문제로 떠오른다.현장에서 가장 자주 활용되는 감도 향상 전략 중 하나가 바로 derivatization(유도체화) 이다. 유도체화는 단순히 “피크를 키워주는 보조 기법” 정도로 오해되기도 하지만, 실제로는 이온화 효율 개선, 크로마토그래피 분리 향상, 선택성 증가, matrix effect 감소 등 여러 효과가 동시에 나타나는, 분석자가 주도적..

― LC-MS/MS 정량 분석의 신뢰도를 결정하는 핵심 요소1. 왜 우리는 “IS(Internal Standard)” 중에서도 Isotopically Labeled IS를 찾게 되는가LC-MS/MS 기반 정량 분석을 처음 접한 사람에게 가장 먼저 가르치는 원리는“모든 분석에는 반드시 Internal Standard가 필요하다”는 단순한 명제이다.하지만 실제 프로젝트를 맡아보면 곧 깨닫게 된다.이 분석이 왜 이렇게 요동치는지, 신호가 왜 이런 식으로 눌리는지,그리고 QC accuracy가 85–115% 사이에서 안정적으로 잡히지 않는 이유가단순히 sample prep 숙련도 때문이 아니라 IS 선택 문제일 수 있다는 사실을.특히 protein precipitation(PPT), SPE, LLE, phosp..

1. 왜 지금 GDV인가: 작은 체적이 가져오는 큰 변화제약·바이오 분석 현장에서 몇 년째 가장 자주 듣는 고민은 “왜 같은 그라디언트 조건인데 RT가 0.2~0.5분씩 밀리지?”라는 질문이다.LC-MS/MS 분석이 안정적으로 돌아갈 때는 아무도 GDV를 언급하지 않는다. 그러나 작업량이 늘고, 분석 대상이 증가하고, 고처리량(HT) 분석이나 긴 Sequence를 돌릴 때 RT가 예측과 다르게 이동하면 문제는 갑자기 심각해진다.특히 최근 국내 제약사에서는 다음과 같은 상황이 더 자주 발생한다.같은 batch 내에서도 전반부·후반부 시료의 RT가 다르게 나타남해외 CRO에서 전달된 gradient 조건을 그대로 복제했는데 retention reproducibility가 맞지 않음column batch ch..

― LC-MS/MS 정량 분석에서 ‘한 개의 Q ion에 의존하는 방식’을 넘어서LC-MS/MS 기반 정량 분석에서 가장 오래된 관습 중 하나는 단일 quantifier ion(MRM transition)에만 의존해 약물 농도를 산출하는 방식이다. 이 방식은 단순하고 실무 적용이 쉽다는 장점이 있지만, 최근 몇 년 사이 제약사 분석팀에서는 다음과 같은 문제들을 반복적으로 경험하게 되면서 결국 단일 Q ion 의존 방식의 한계를 드러내기 시작했다.Matrix effect가 특정 fragment만 선택적으로 억제Low-level quantitation에서 간헐적 peak distortionLot-to-lot matrix 변화(혈장·전혈·소변·조직)에서 signal driftInterference 신호가 qu..

LC-MS/MS에서 가장 과소평가되지만 실제 분석 현장에서 결과 재현성을 결정짓는 절대 요소는 바로 spray stability이다. 특히 최근 국내 제약사 분석팀에서 HRMS 기반 대사체 분석, 약물 대사체 구조 동정, low-fg 수준 약물 모니터링 연구가 증가하면서, 기존 micrometer-sized ESI emitter 대신 nano-flow 기반 nano-ESI emitter 사용이 빠르게 늘고 있다. 하지만 nano-flow LC 시스템은 예민하고, emitter 팁 구조·전압·거리·용매 조성 변화에 따라 스프레이가 즉시 붕괴되거나 방울형 모드로 전환되기 때문에, 많은 연구자들이 “감도는 좋은데 재현성이 너무 떨어지는” 문제를 경험하게 된다.이 글에서는 nano-ESI emitter에서의 s..

— 혈장, 전혈, 소변, 조직에서의 LC-MS/MS ion suppression 실무 가이드LC-MS/MS 기반 바이오애널리틱스에서 ion suppression (또는 enhancement) 은 정량 정확도와 재현성을 해치는 가장 흔한 문제 중 하나다. 같은 분석법을 서로 다른 matrix(혈장, 전혈, 소변, 조직)에 적용하면, matrix에 포함된 성분(지질, 단백질, 염류, 담즙산류, 대사물 등)이 이온화 효율에 미치는 영향이 달라져 같은 화합물이라도 정량 결과가 달라진다. 따라서 matrix별 ion suppression 특성을 체계적으로 비교하고, 그 결과를 바탕으로 분석법(전처리, internal standard 전략, chromatography, MS 설정 등)을 최적화하는 것은 제약사·CR..

― 국내 제약사 분석팀을 위한 현실적 활용 전략과 workflow 비교1. 서론: 두 기기의 목적은 “서로 다르고”, 그래서 “서로 필요하다”신약 개발 과정에서 약물 분석팀은 항상 두 가지 요구 사이를 오가게 된다.하나는 정확한 농도 측정, 다른 하나는 약물이 어떤 형태로 변하는지 구조적으로 파악하는 것이다.그래서 대부분의 제약사 분석실에는 두 종류의 장비가 공존한다.HRMS(High Resolution Mass Spectrometry)→ Q-TOF, Orbitrap 등→ 정체를 알 수 없는 unknowns를 밝히는 장비Triple Quadrupole (Triple Quad, QqQ)→ TSQ, 6500+, 8060 등→ 정량을 위해 존재하는 장비이 둘은 가격도 다르고, 분석 속도도 다르고, 분석에서 수..