Statistical cutoff 설정의 함정
p-value 하나로 biology를 자르는 순간 벌어지는 일들Proteomics 데이터를 처음 분석하면 가장 먼저 배우는 것 중 하나가 cutoff다.p-value fold change > 2FDR 논문 대부분도 비슷한 기준을 사용한다. Volcano plot에는 빨간 점과 회색 점이 나뉘어 있고, significant protein list가 pathway analysis로 이어진다. 그래서 자연스럽게 이런 생각을 하게 된다.“통계 기준을 통과한 protein은 진짜 biology겠지.”실제로 statistical cutoff는 필요하다. Proteomics 데이터는 noise가 많고, thousands of proteins를 동시에 비교하기 때문에 우연한 변화도 계속 발생한다. 어떤 기준선은 반드시..
제약산업
2026. 5. 31. 19:25
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