Data-dependent acquisition (DDA) vs Data-independent acquisition (DIA)

LC-MS/MS 기반 metabolomics·proteomics에서의 스펙트럼 수집 전략 비교와 국내 제약사 실험 환경에서의 활용 기준LC-MS/MS 데이터를 다루다 보면, 분석자가 처음 맞닥뜨리는 의문 중 하나가 바로 “DDA를 쓸지, DIA를 쓸지”다.처음에는 단순히 targeted vs untargeted로 구분하는 것처럼 보이지만, 실제로는 이 둘의 차이가 훨씬 복잡하고, 분석 workflow 전체―즉 데이터 품질, 재현성, quantification precision, identification confidence, downstream 통계, 심지어 임상 적용성까지―에 아주 깊게 관여한다.내가 분석팀에서 일하면서 느낀 DDA vs DIA의 차이를 정리해보면 이렇다.DDA는 샘플이 가진 정보 중 ..
제약산업 2025. 11. 21. 20:18
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