제약회사 연구원의 블로그

LC-MS/MS와 고급 동위원소 대사 분석 기법으로 암세포의 ‘실시간 대사 흐름’을 읽어내는 방법1. 서론 – 왜 종양 대사 연구에서 ‘Flux(흐름)’이 중요한가암세포의 대사는 교과서적인 생화학 경로만으로는 설명할 수 없는 복잡한 유연성을 가진다.특정 경로가 억제되면 다른 우회 경로가 즉각적으로 활성화되고, 영양소 공급 환경이 바뀌면 마치 스위치를 바꾸듯 탄수화물·아미노산·지질 대사 흐름의 비중이 재조정된다.이런 특성 때문에 종양 대사를 이해할 때 흔히 범하는 실수가 하나 있다.정적 농도(concentration)만 보고 대사 흐름(activity)을 해석하려는 것대사체 농도는 그 자체로 중요한 정보이지만, 농도가 높다고 해서 해당 경로가 활발히 작동한다는 의미는 아니다.이는 생성속도, 분해속도, 반응..

– LC-MS/MS 기반 종양 대사 리프로그래밍 규명 전략 –1. 서론: 종양 대사 연구와 Stable Isotope Tracing의 필요성암세포는 정상세포와 달리 대사 리프로그래밍(metabolic reprogramming)을 통해 생존과 증식을 유리하게 이끌어간다. 대표적으로 Warburg effect (aerobic glycolysis), glutamine addiction, one-carbon metabolism 활성화, lipid synthesis 증가 등이 잘 알려져 있다. 그러나 이러한 대사 변화는 동적이고 맥락 의존적이어서 단순한 steady-state metabolomics만으로는 기전적 이해가 어렵다.이때 Stable isotope tracing (SIT), 즉 안정 동위원소 표지를 활..