제약회사 연구원의 블로그

Proteomics에서 “정제 과정”이라고 믿었던 단계가 proteome 자체를 바꿔버리는 순간Proteomics workflow에서 protein precipitation은 너무 익숙한 과정이다. Acetone precipitation, methanol/chloroform precipitation, ethanol precipitation 같은 방법은 거의 기본 protocol처럼 사용된다. Detergent를 제거하고, buffer를 교체하고, unwanted contaminant를 정리하기 위해 많은 실험실이 precipitation 단계를 routine하게 넣는다.특히 SDS 같은 강한 detergent를 사용한 뒤에는 precipitation이 거의 필수처럼 여겨진다. 그렇지 않으면 downstr..

“전처리는 기술이 아니라 전략이다”LC-MS/MS 기반 bioanalysis에서sample preparation은 흔히 이렇게 취급된다.“이미 정해진 루틴”“분석 전에 그냥 거치는 단계”“LC-MS 조건이 더 중요하다”그러나 실제 프로젝트 경험이 쌓일수록분석팀은 한 가지 사실을 뼈저리게 느낀다.문제가 생기는 지점의 70% 이상은LC나 MS가 아니라 sample preparation이다.Protein precipitation(PPT),Solid-phase extraction(SPE),Liquid–liquid extraction(LLE).이 세 가지 전처리 기법은교과서적으로는 장단점이 명확해 보이지만,실제 현장에서는 분석 목적에 따라 평가 기준이 완전히 달라진다.이 글에서는“어떤 전처리가 가장 좋은가?”가 ..