Peptide = Protein이라고 생각하는 위험성

— 우리가 보고 있는 것은 단백질이 아니라, 단백질의 ‘조각’이다처음 proteomics 데이터를 접하면자연스럽게 이렇게 생각하게 된다.“이건 단백질 데이터다”리스트에는 단백질 이름이 있고,각각의 abundance 값이 있고,그 변화가 정리되어 있다.그래서 해석도 자연스럽게 이어진다.이 단백질이 증가했다이 단백질이 감소했다이건 너무 당연한 흐름이라대부분 의심하지 않는다.하지만 proteomics를 조금 더 깊이 들여다보면이 전제가 얼마나 위험한지 보이기 시작한다.우리는 단백질을 직접 측정하지 않는다LC-MS 기반 proteomics에서실제로 측정하는 것은 단백질이 아니다.우리는trypsin으로 단백질을 잘라서peptide를 만들고그 peptide의 signal을 측정한다즉,proteomics는 prote..
제약산업 2026. 5. 1. 20:09
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