Lysis buffer 조성이 proteome을 왜곡하는 방식
같은 샘플인데 왜 buffer 하나 바꿨을 뿐인데 결과가 달라질까Proteomics 실험을 하다 보면 어느 순간부터 이상한 경험을 반복하게 된다. 분명 같은 세포를 사용했고, 같은 장비에서 분석했으며, digestion protocol도 거의 동일한데 특정 단백질군만 유독 달라지는 경우다. 어떤 실험에서는 membrane protein이 풍부하게 검출되는데, 다른 실험에서는 cytosolic protein 위주로 결과가 쏠린다. 때로는 signaling pathway 전체가 약해지거나, 반대로 특정 stress-related protein이 과도하게 증가하는 패턴이 나타나기도 한다.처음에는 biological variability처럼 보인다. 실제 세포 상태가 달랐다고 생각하기 쉽다. 하지만 raw da..
제약산업
2026. 5. 15. 20:10
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