단백질 추출 방법이 proteomics 결과를 바꾸는 이유

같은 조직인데 왜 extraction protocol 하나로 proteome이 달라질까Proteomics 실험을 처음 설계할 때 많은 사람들이 가장 중요하게 생각하는 단계는 mass spectrometry 분석 조건이다. 어떤 instrument를 사용할지, DIA와 DDA 중 무엇을 선택할지, fragmentation energy는 어떻게 조정할지 같은 요소들에 관심이 집중된다. 반면 단백질 추출 단계는 상대적으로 단순한 준비 과정처럼 취급되는 경우가 많다. 조직을 lysate buffer에 넣고 깨뜨린 뒤 단백질을 녹여내는 과정 정도로 생각하기 쉽다.하지만 실제 데이터를 오래 보다 보면 생각이 달라진다. 같은 조직을 사용했는데 extraction buffer만 바뀌어도 검출되는 protein popu..
제약산업 2026. 5. 14. 20:06
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