Batch effect 심화_ Proteomics 데이터에서 보이지 않는 왜곡의 구조
1. 왜 proteomics에서 Batch effect는 metabolomics보다 더 심각한가Metabolomics에서도 batch effect는 문제지만, proteomics에서는 다음 이유로 훨씬 증폭됩니다.✔ 단백질은 “측정 대상”이 아니라 “추론 대상”펩타이드 → 단백질 매핑 과정 존재missing peptide → 단백질 정량 왜곡batch별 peptide detection 차이 → 단백질 abundance drift✔ 샘플 준비 과정이 길고 복잡digestion efficiencydesalting recoverylabeling efficiency (TMT 등)✔ 장비 조건의 미세 변화에 매우 민감spray stabilityion transmissioncollision energy drift?..
제약산업
2026. 3. 14. 20:28
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